Heterotonija ir tāda baltu valodās sastopama fonoloģiska parādība, ka dažādas nozīmes vārdi vai gramatiskas formas izrunā atšķiras tikai ar intonāciju vienā vai vairākās zilbēs. Heterotonu vārdnīca pieder pie pirmreizīgiem pētījumiem akcentoloģijā, kas aicina nejaukt zilbju intonācijas. Vārdnīca satur vairāk nekā 800 heterotonu vienību.